Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMUB2Q71RG4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMUB2Q71RG4 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms