Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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