Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A10Q6U841 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms