Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC42EP5Q6NZY7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms