Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
APOBEC3HQ6NTF7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms