Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms