Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP9Q5VTM2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP9Q5VTM2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP9Q5VTM2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP9Q5VTM2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP9Q5VTM2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP9Q5VTM2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP9Q5VTM2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP9Q5VTM2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP9Q5VTM2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP9Q5VTM2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP9Q5VTM2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP9Q5VTM2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP9Q5VTM2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP9Q5VTM2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP9Q5VTM2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP9Q5VTM2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP9Q5VTM2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP9Q5VTM2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP9Q5VTM2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP9Q5VTM2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP9Q5VTM2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP9Q5VTM2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP9Q5VTM2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AGAP9Q5VTM2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms