Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIF1Q5UIP0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RIF1Q5UIP0 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms