Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM164Q5U3C3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms