Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOGA3Q5TF21 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SOGA3Q5TF21 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms