Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC178Q5BJE1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms