Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNNI3KQ59H18 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms