Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms