Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms