Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms