Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3G0

ABCB5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB5Q2M3G0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCB5Q2M3G0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCB5Q2M3G0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCB5Q2M3G0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCB5Q2M3G0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCB5Q2M3G0 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCB5Q2M3G0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCB5Q2M3G0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCB5Q2M3G0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCB5Q2M3G0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCB5Q2M3G0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCB5Q2M3G0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCB5Q2M3G0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCB5Q2M3G0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCB5Q2M3G0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCB5Q2M3G0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCB5Q2M3G0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCB5Q2M3G0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCB5Q2M3G0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCB5Q2M3G0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCB5Q2M3G0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCB5Q2M3G0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCB5Q2M3G0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCB5Q2M3G0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCB5Q2M3G0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCB5Q2M3G0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCB5Q2M3G0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCB5Q2M3G0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCB5Q2M3G0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCB5Q2M3G0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCB5Q2M3G0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCB5Q2M3G0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCB5Q2M3G0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCB5Q2M3G0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCB5Q2M3G0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCB5Q2M3G0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCB5Q2M3G0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCB5Q2M3G0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCB5Q2M3G0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCB5Q2M3G0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms