Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR3

QSER1, Glutamine and serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QSER1Q2KHR3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
QSER1Q2KHR3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms