Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FSCN1Q16658 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FSCN1Q16658 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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