Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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