Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ITSN1Q15811 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITSN1Q15811 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
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