Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK1Q15118 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK1Q15118 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK1Q15118 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK1Q15118 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK1Q15118 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK1Q15118 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK1Q15118 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK1Q15118 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK1Q15118 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK1Q15118 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK1Q15118 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
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PDK1Q15118 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK1Q15118 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK1Q15118 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK1Q15118 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK1Q15118 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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PDK1Q15118 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK1Q15118 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK1Q15118 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK1Q15118 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK1Q15118 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK1Q15118 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK1Q15118 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK1Q15118 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK1Q15118 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK1Q15118 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK1Q15118 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK1Q15118 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK1Q15118 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK1Q15118 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK1Q15118 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK1Q15118 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK1Q15118 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK1Q15118 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK1Q15118 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK1Q15118 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK1Q15118 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK1Q15118 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK1Q15118 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK1Q15118 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK1Q15118 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK1Q15118 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK1Q15118 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK1Q15118 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK1Q15118 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK1Q15118 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK1Q15118 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK1Q15118 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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