Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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