Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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COL4A6Q14031 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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COL4A6Q14031 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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COL4A6Q14031 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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COL4A6Q14031 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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COL4A6Q14031 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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COL4A6Q14031 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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COL4A6Q14031 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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COL4A6Q14031 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
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COL4A6Q14031 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL4A6Q14031 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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