Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDE7AQ13946 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE7AQ13946 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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