Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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