Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms