Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP4Q09028 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms