Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms