Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms