Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EGR3Q06889 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms