Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms