Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms