Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms