Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms