Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HBBP68871 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HBBP68871 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HBBP68871 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HBBP68871 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HBBP68871 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HBBP68871 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HBBP68871 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HBBP68871 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HBBP68871 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HBBP68871 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HBBP68871 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HBBP68871 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HBBP68871 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HBBP68871 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HBBP68871 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HBBP68871 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HBBP68871 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HBBP68871 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HBBP68871 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HBBP68871 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HBBP68871 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HBBP68871 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HBBP68871 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HBBP68871 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HBBP68871 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HBBP68871 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HBBP68871 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HBBP68871 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HBBP68871 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HBBP68871 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HBBP68871 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HBBP68871 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HBBP68871 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HBBP68871 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HBBP68871 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HBBP68871 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HBBP68871 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HBBP68871 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HBBP68871 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HBBP68871 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HBBP68871 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HBBP68871 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HBBP68871 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HBBP68871 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HBBP68871 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HBBP68871 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HBBP68871 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HBBP68871 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HBBP68871 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HBBP68871 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HBBP68871 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HBBP68871 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HBBP68871 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HBBP68871 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HBBP68871 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HBBP68871 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HBBP68871 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HBBP68871 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HBBP68871 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HBBP68871 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HBBP68871 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HBBP68871 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HBBP68871 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HBBP68871 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HBBP68871 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HBBP68871 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HBBP68871 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HBBP68871 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HBBP68871 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HBBP68871 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HBBP68871 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HBBP68871 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HBBP68871 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HBBP68871 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HBBP68871 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HBBP68871 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HBBP68871 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HBBP68871 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HBBP68871 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HBBP68871 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HBBP68871 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HBBP68871 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HBBP68871 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HBBP68871 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HBBP68871 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HBBP68871 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HBBP68871 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HBBP68871 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HBBP68871 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HBBP68871 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HBBP68871 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HBBP68871 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HBBP68871 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HBBP68871 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HBBP68871 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HBBP68871 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HBBP68871 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HBBP68871 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HBBP68871 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms