Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms