Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GNB1P62873 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GNB1P62873 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GNB1P62873 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GNB1P62873 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GNB1P62873 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNB1P62873 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GNB1P62873 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GNB1P62873 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GNB1P62873 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GNB1P62873 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GNB1P62873 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GNB1P62873 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GNB1P62873 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GNB1P62873 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GNB1P62873 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GNB1P62873 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GNB1P62873 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GNB1P62873 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GNB1P62873 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GNB1P62873 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GNB1P62873 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
GNB1P62873 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GNB1P62873 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GNB1P62873 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
GNB1P62873 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GNB1P62873 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GNB1P62873 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GNB1P62873 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GNB1P62873 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GNB1P62873 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GNB1P62873 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GNB1P62873 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GNB1P62873 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GNB1P62873 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GNB1P62873 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GNB1P62873 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GNB1P62873 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GNB1P62873 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GNB1P62873 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GNB1P62873 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GNB1P62873 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GNB1P62873 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GNB1P62873 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GNB1P62873 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GNB1P62873 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GNB1P62873 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GNB1P62873 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GNB1P62873 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GNB1P62873 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNB1P62873 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNB1P62873 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GNB1P62873 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GNB1P62873 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNB1P62873 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GNB1P62873 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GNB1P62873 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GNB1P62873 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNB1P62873 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GNB1P62873 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GNB1P62873 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNB1P62873 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GNB1P62873 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GNB1P62873 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GNB1P62873 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GNB1P62873 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GNB1P62873 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GNB1P62873 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GNB1P62873 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GNB1P62873 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GNB1P62873 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNB1P62873 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNB1P62873 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GNB1P62873 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNB1P62873 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GNB1P62873 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNB1P62873 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNB1P62873 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GNB1P62873 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GNB1P62873 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNB1P62873 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNB1P62873 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNB1P62873 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNB1P62873 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GNB1P62873 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNB1P62873 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNB1P62873 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GNB1P62873 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GNB1P62873 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNB1P62873 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNB1P62873 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNB1P62873 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNB1P62873 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GNB1P62873 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNB1P62873 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNB1P62873 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNB1P62873 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNB1P62873 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNB1P62873 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GNB1P62873 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms