Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERFP50548 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERFP50548 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERFP50548 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERFP50548 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERFP50548 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERFP50548 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERFP50548 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERFP50548 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERFP50548 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERFP50548 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERFP50548 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERFP50548 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERFP50548 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERFP50548 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERFP50548 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERFP50548 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERFP50548 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERFP50548 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ERFP50548 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERFP50548 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERFP50548 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERFP50548 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERFP50548 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERFP50548 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERFP50548 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ERFP50548 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERFP50548 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERFP50548 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERFP50548 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERFP50548 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERFP50548 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERFP50548 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERFP50548 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERFP50548 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ERFP50548 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ERFP50548 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERFP50548 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERFP50548 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERFP50548 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERFP50548 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERFP50548 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERFP50548 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERFP50548 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERFP50548 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERFP50548 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERFP50548 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERFP50548 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERFP50548 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERFP50548 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERFP50548 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERFP50548 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERFP50548 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERFP50548 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERFP50548 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERFP50548 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERFP50548 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERFP50548 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERFP50548 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERFP50548 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERFP50548 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERFP50548 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERFP50548 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERFP50548 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ERFP50548 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERFP50548 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERFP50548 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERFP50548 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERFP50548 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERFP50548 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERFP50548 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERFP50548 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERFP50548 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERFP50548 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERFP50548 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERFP50548 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERFP50548 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERFP50548 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERFP50548 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERFP50548 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERFP50548 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERFP50548 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERFP50548 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERFP50548 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERFP50548 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERFP50548 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ERFP50548 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERFP50548 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERFP50548 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERFP50548 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERFP50548 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERFP50548 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERFP50548 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERFP50548 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERFP50548 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERFP50548 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERFP50548 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERFP50548 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ERFP50548 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERFP50548 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms