Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF6P49848 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF6P49848 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF6P49848 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF6P49848 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF6P49848 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TAF6P49848 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TAF6P49848 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TAF6P49848 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TAF6P49848 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TAF6P49848 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TAF6P49848 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TAF6P49848 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TAF6P49848 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TAF6P49848 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TAF6P49848 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TAF6P49848 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TAF6P49848 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF6P49848 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF6P49848 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF6P49848 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF6P49848 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF6P49848 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF6P49848 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF6P49848 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF6P49848 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF6P49848 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF6P49848 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TAF6P49848 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF6P49848 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF6P49848 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF6P49848 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF6P49848 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF6P49848 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF6P49848 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF6P49848 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF6P49848 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF6P49848 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF6P49848 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF6P49848 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF6P49848 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF6P49848 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF6P49848 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF6P49848 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF6P49848 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF6P49848 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF6P49848 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF6P49848 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF6P49848 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TAF6P49848 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF6P49848 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF6P49848 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF6P49848 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF6P49848 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF6P49848 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF6P49848 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF6P49848 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF6P49848 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF6P49848 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF6P49848 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF6P49848 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF6P49848 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF6P49848 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF6P49848 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF6P49848 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF6P49848 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF6P49848 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF6P49848 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF6P49848 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF6P49848 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF6P49848 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF6P49848 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF6P49848 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF6P49848 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF6P49848 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF6P49848 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF6P49848 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF6P49848 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF6P49848 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF6P49848 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF6P49848 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF6P49848 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF6P49848 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF6P49848 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF6P49848 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF6P49848 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF6P49848 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TAF6P49848 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF6P49848 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF6P49848 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF6P49848 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF6P49848 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF6P49848 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF6P49848 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF6P49848 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF6P49848 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF6P49848 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF6P49848 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF6P49848 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF6P49848 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms