Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK1A1P48729 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms