Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKARP32238 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKARP32238 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKARP32238 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKARP32238 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKARP32238 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKARP32238 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKARP32238 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKARP32238 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKARP32238 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKARP32238 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKARP32238 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKARP32238 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKARP32238 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKARP32238 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKARP32238 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKARP32238 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKARP32238 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKARP32238 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKARP32238 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKARP32238 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKARP32238 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKARP32238 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKARP32238 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKARP32238 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKARP32238 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKARP32238 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKARP32238 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKARP32238 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKARP32238 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKARP32238 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKARP32238 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKARP32238 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKARP32238 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKARP32238 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKARP32238 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKARP32238 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKARP32238 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKARP32238 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKARP32238 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKARP32238 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKARP32238 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKARP32238 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKARP32238 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKARP32238 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKARP32238 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKARP32238 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKARP32238 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKARP32238 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKARP32238 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKARP32238 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKARP32238 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKARP32238 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKARP32238 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKARP32238 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKARP32238 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKARP32238 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKARP32238 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKARP32238 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKARP32238 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKARP32238 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKARP32238 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKARP32238 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKARP32238 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKARP32238 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKARP32238 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKARP32238 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKARP32238 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKARP32238 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKARP32238 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKARP32238 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKARP32238 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKARP32238 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKARP32238 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKARP32238 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKARP32238 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKARP32238 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKARP32238 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKARP32238 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCKARP32238 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCKARP32238 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCKARP32238 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCKARP32238 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKARP32238 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKARP32238 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKARP32238 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKARP32238 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKARP32238 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKARP32238 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKARP32238 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKARP32238 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKARP32238 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKARP32238 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKARP32238 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKARP32238 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKARP32238 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKARP32238 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKARP32238 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKARP32238 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKARP32238 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms