Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPS1P31327 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CPS1P31327 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CPS1P31327 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPS1P31327 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPS1P31327 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPS1P31327 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPS1P31327 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPS1P31327 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPS1P31327 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPS1P31327 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPS1P31327 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPS1P31327 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPS1P31327 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPS1P31327 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPS1P31327 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPS1P31327 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPS1P31327 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPS1P31327 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPS1P31327 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPS1P31327 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPS1P31327 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPS1P31327 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPS1P31327 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPS1P31327 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPS1P31327 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPS1P31327 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPS1P31327 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPS1P31327 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CPS1P31327 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPS1P31327 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CPS1P31327 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPS1P31327 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPS1P31327 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CPS1P31327 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPS1P31327 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPS1P31327 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPS1P31327 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPS1P31327 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPS1P31327 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPS1P31327 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPS1P31327 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPS1P31327 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPS1P31327 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPS1P31327 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPS1P31327 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPS1P31327 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPS1P31327 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPS1P31327 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPS1P31327 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPS1P31327 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPS1P31327 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPS1P31327 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPS1P31327 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPS1P31327 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPS1P31327 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPS1P31327 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPS1P31327 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPS1P31327 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPS1P31327 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPS1P31327 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPS1P31327 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPS1P31327 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CPS1P31327 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPS1P31327 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPS1P31327 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPS1P31327 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPS1P31327 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPS1P31327 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPS1P31327 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPS1P31327 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPS1P31327 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPS1P31327 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPS1P31327 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPS1P31327 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPS1P31327 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPS1P31327 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPS1P31327 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPS1P31327 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPS1P31327 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPS1P31327 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPS1P31327 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPS1P31327 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CPS1P31327 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPS1P31327 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPS1P31327 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPS1P31327 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPS1P31327 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPS1P31327 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPS1P31327 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPS1P31327 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CPS1P31327 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
CPS1P31327 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CPS1P31327 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CPS1P31327 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CPS1P31327 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CPS1P31327 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPS1P31327 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPS1P31327 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPS1P31327 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms