Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

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Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APCP25054 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APCP25054 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APCP25054 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APCP25054 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APCP25054 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APCP25054 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APCP25054 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APCP25054 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APCP25054 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APCP25054 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APCP25054 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APCP25054 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APCP25054 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.06
APCP25054 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
APCP25054 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.39■□□□□ 0.06
APCP25054 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.39■□□□□ 0.06
APCP25054 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.39■□□□□ 0.06
APCP25054 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
APCP25054 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.06
APCP25054 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APCP25054 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APCP25054 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APCP25054 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APCP25054 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APCP25054 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APCP25054 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APCP25054 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APCP25054 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APCP25054 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APCP25054 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APCP25054 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APCP25054 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APCP25054 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APCP25054 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APCP25054 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APCP25054 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APCP25054 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APCP25054 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APCP25054 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APCP25054 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APCP25054 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APCP25054 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APCP25054 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APCP25054 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APCP25054 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APCP25054 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APCP25054 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APCP25054 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APCP25054 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APCP25054 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APCP25054 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APCP25054 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCP25054 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCP25054 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCP25054 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCP25054 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCP25054 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCP25054 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCP25054 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCP25054 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCP25054 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCP25054 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APCP25054 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCP25054 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APCP25054 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCP25054 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APCP25054 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APCP25054 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCP25054 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCP25054 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCP25054 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCP25054 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCP25054 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCP25054 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCP25054 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCP25054 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCP25054 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCP25054 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APCP25054 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCP25054 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCP25054 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCP25054 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCP25054 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCP25054 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCP25054 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCP25054 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCP25054 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCP25054 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APCP25054 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCP25054 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCP25054 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCP25054 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCP25054 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APCP25054 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCP25054 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCP25054 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APCP25054 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCP25054 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APCP25054 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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