Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms