Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NME1P15531 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NME1P15531 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NME1P15531 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NME1P15531 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NME1P15531 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NME1P15531 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NME1P15531 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NME1P15531 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NME1P15531 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NME1P15531 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NME1P15531 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NME1P15531 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NME1P15531 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME1P15531 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME1P15531 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME1P15531 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME1P15531 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME1P15531 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME1P15531 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME1P15531 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME1P15531 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME1P15531 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME1P15531 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME1P15531 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME1P15531 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME1P15531 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME1P15531 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME1P15531 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME1P15531 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME1P15531 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NME1P15531 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME1P15531 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME1P15531 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME1P15531 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME1P15531 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME1P15531 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME1P15531 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NME1P15531 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME1P15531 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME1P15531 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME1P15531 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NME1P15531 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NME1P15531 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NME1P15531 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NME1P15531 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NME1P15531 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NME1P15531 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME1P15531 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME1P15531 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME1P15531 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME1P15531 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME1P15531 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME1P15531 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME1P15531 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME1P15531 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME1P15531 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME1P15531 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME1P15531 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME1P15531 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NME1P15531 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME1P15531 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME1P15531 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NME1P15531 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME1P15531 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME1P15531 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME1P15531 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME1P15531 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME1P15531 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME1P15531 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME1P15531 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME1P15531 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME1P15531 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME1P15531 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME1P15531 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NME1P15531 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME1P15531 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME1P15531 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME1P15531 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME1P15531 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME1P15531 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME1P15531 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME1P15531 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME1P15531 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NME1P15531 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME1P15531 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME1P15531 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME1P15531 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME1P15531 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME1P15531 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME1P15531 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME1P15531 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NME1P15531 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME1P15531 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME1P15531 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME1P15531 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME1P15531 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME1P15531 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME1P15531 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NME1P15531 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms