Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HSP90AB1P08238 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms