Protein–RNA interactions for Protein: O75419

CDC45, Cell division control protein 45 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC45O75419 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC45O75419 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC45O75419 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC45O75419 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC45O75419 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC45O75419 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC45O75419 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC45O75419 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC45O75419 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC45O75419 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC45O75419 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC45O75419 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC45O75419 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC45O75419 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC45O75419 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC45O75419 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC45O75419 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC45O75419 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC45O75419 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC45O75419 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC45O75419 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC45O75419 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC45O75419 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC45O75419 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC45O75419 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC45O75419 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC45O75419 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC45O75419 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC45O75419 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC45O75419 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC45O75419 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC45O75419 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC45O75419 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC45O75419 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC45O75419 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC45O75419 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC45O75419 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC45O75419 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC45O75419 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC45O75419 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC45O75419 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC45O75419 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC45O75419 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC45O75419 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC45O75419 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC45O75419 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC45O75419 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC45O75419 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC45O75419 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC45O75419 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC45O75419 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC45O75419 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC45O75419 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC45O75419 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC45O75419 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC45O75419 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC45O75419 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC45O75419 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC45O75419 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC45O75419 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC45O75419 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC45O75419 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC45O75419 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC45O75419 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC45O75419 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC45O75419 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC45O75419 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC45O75419 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC45O75419 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC45O75419 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC45O75419 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC45O75419 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC45O75419 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC45O75419 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC45O75419 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC45O75419 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC45O75419 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC45O75419 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC45O75419 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC45O75419 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC45O75419 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC45O75419 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC45O75419 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC45O75419 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC45O75419 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC45O75419 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC45O75419 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC45O75419 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC45O75419 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC45O75419 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC45O75419 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC45O75419 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC45O75419 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC45O75419 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC45O75419 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC45O75419 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC45O75419 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC45O75419 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC45O75419 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC45O75419 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms