Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms