Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPLO60437 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPLO60437 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPLO60437 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPLO60437 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPLO60437 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPLO60437 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPLO60437 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPLO60437 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPLO60437 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPLO60437 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPLO60437 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPLO60437 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PPLO60437 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPLO60437 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPLO60437 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPLO60437 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPLO60437 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPLO60437 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPLO60437 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPLO60437 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPLO60437 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPLO60437 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPLO60437 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPLO60437 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPLO60437 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPLO60437 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPLO60437 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPLO60437 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPLO60437 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPLO60437 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PPLO60437 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPLO60437 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPLO60437 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPLO60437 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPLO60437 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPLO60437 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPLO60437 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PPLO60437 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PPLO60437 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PPLO60437 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPLO60437 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPLO60437 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPLO60437 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PPLO60437 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPLO60437 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPLO60437 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPLO60437 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPLO60437 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPLO60437 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPLO60437 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPLO60437 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPLO60437 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPLO60437 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPLO60437 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPLO60437 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPLO60437 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPLO60437 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPLO60437 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPLO60437 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPLO60437 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPLO60437 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPLO60437 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPLO60437 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPLO60437 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPLO60437 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PPLO60437 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPLO60437 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPLO60437 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PPLO60437 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PPLO60437 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PPLO60437 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPLO60437 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPLO60437 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPLO60437 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPLO60437 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPLO60437 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPLO60437 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPLO60437 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPLO60437 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PPLO60437 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPLO60437 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPLO60437 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPLO60437 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPLO60437 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPLO60437 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPLO60437 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPLO60437 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPLO60437 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPLO60437 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPLO60437 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PPLO60437 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PPLO60437 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PPLO60437 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPLO60437 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPLO60437 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PPLO60437 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPLO60437 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PPLO60437 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPLO60437 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms