Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HTATSF1O43719 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTATSF1O43719 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms